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不明国籍的少女柠檬突然出现在小新面前，给他带来了偶像动感超人的讯息：“新之助君，从今天起你就是实战间谍了。和我一起为正义而战吧！”喜出望外的小新开始在柠檬的指导下进行特训，两人组成了间谍搭档，飞速成长。动感超人终于下达了新的指令：“邪恶博士藏匿了我的正义胶囊，将它夺回。”行动开始，小新潜入邪恶博士的研究所，见到了博士。谁知博士竟说出了惊人的话：“你被骗了，这不是什么正义胶囊，而是一种危险物质！”小新为何被选为间谍？正义胶囊真的是危险物质？柠檬又是何来历？正义、背叛、友情、秘密……一个傻傻的五岁幼儿园小朋友

污垢达人正计划将整个地球变成一个大温泉，政府的秘密组织温泉G组为了阻止他们的野心，到处寻找黄金之魂温泉，希望借温泉的神力打倒坏蛋。没想到黄金之魂温泉居然就在小新家的地底下，就这样他们一家人卷入了守护温泉的正邪之战。最后，因为小新一家人同心协力，终于打倒了污垢达人，拯救世界和平。

昔日孩童时期总是一起结伴同玩的6位好朋友，在察觉到的时候，他们的关系便因各自升上了高中而疏离了。但某一天，虽然各种事物都在变化，但唯独不变的女主角本间芽衣子却突然出现在已像隐蔽青年般的主人公宿海仁太面前，虽然芽衣子说她要让仁太帮她达成愿望，但当仁太也去了解她的愿望时，却发现她的愿望只是想把昔日要好的儿时玩伴再次聚集。

这是女孩们为了登上巅峰成为“三菱镜皇后（Prism Queen）”的故事。对打扮很有自信、但是内向而且运动无能，由于突发事件而参加“三菱镜表演”的爱良。以传说中的跳跃“极光上升”为目标、带着天生的开朗性格接受着课程的律舞。偶然相遇的二人，虽然时而吵架，时而苦恼，但是继续着磨练歌舞和时尚的品位，通过“三菱镜表演”追逐着各自的梦想。

就读于拥有悠久庄严历史的圣玛格丽特学园的留学的东方少年久城一弥，某天他在学园图书馆塔上方、绿意盎然的房间内与一位身着华丽服装、犹如洋娃娃般美丽的少女——维多利加相遇。维多利加拥有如侦探一般聪明的头脑和敏锐的洞察力，只要在她所到之处，再怎么离奇的谜团都会被解开。之后维多利加与久城一弥遭遇了种种怪异离奇事件，那么他们又该怎么解决这一系列的难题呢?

作品内容大致是以一个生活在海底的乌贼娘对于人类污染大海的行为无法忍受，而挺身出海决定要教训一下人类而展开的轻松故事。虽然目的是征服人类，但却因为缺乏常识而被各种各样的新事物吓到，继而沦为了在一个不起眼的沙滩小店打工的店员，之后的故事以各种联系不紧密的单元剧形式进行。

主人公桂木桂马是少女恋爱游戏的高手，神乎其技的他可以同时玩六款游戏，还可以分别享受其中剧情，也因此桂马被称做“攻陷之神”。而被称为神的桂马遇上了来自地狱的恶魔，成为负责逮捕从地狱逃到人间的驱魂，于是要对现实生活中的女生展开“攻略”，填满她们的芳心，让驱魂无处可躲。

这日柯南、小兰一行人来到米花市市政大厅，一场有关最新游戏“茧”的发布会正在这里召开。由于迥异于以往任何一款游戏的“茧”可能一举改变全球游戏业界的价值观，发布会吸引了代表日本上流社会的政治、财经、演艺界人士，50名游戏体验者也多是他们的后代，新一的父亲、推理小说大师工藤优作由于参与故事编写，也来到现场。这边热热闹闹，游戏的研发者兼负责人坚村却被杀于地下室。坚村死前留在键盘J、T、R上的血迹令柯南想到答案可能在游戏中，他利用优作的关系加入了体验者队伍，小兰、灰原哀等人也拿到了体验入场券。

东京、大阪、京都相继发生杀人事件，5名死者皆是被头戴面具的黑影人用武士刀和弓箭瞬间杀害。警方介入调查，发现死者都是出没于3地专门偷窃有名的佛像及美术品的偷盗集团“源氏萤”成员。该集团共有成员8名，以义经的家臣名字互相称呼，且都持有一本《义经记》，被害5人手中的《义经记》均被拿走。

目暮警官、小兰的母亲妃英里、阿笠博士接连遭到不明身份之人的暗算。柯南追踪伤害阿笠博士的凶手，他根据几起案件现场留下的线索发现凶手按照扑克牌的顺序行凶，而且遇害者皆与毛利小五郎有关。目暮提供的线索初步揭开事情的真相，原来毛利当年任职警察的时候曾经逮捕犯下杀人罪的赌徒村上丈，当年也更因这一事件导致毛利离职以及婚姻变故。十年后，服刑期满的村上丈出狱，开始按照扑克牌的顺序向毛利身边之人展开报复。在得知原委后，毛利努力寻找身边与数字有关的人。在这一过程中，各种惊险场面接连出现。而柯南也对案件的真相产生疑惑。